Nekropolis Vatikan, terletak di bawah kota Vatikan, pada kedalaman yang beragam, antara 5-12 meter di bawah Basilika Santo Petrus. Vatikan mensponsori penggalian arkeologi di bawah Basilika pada tahun 1940-1949 dan menemukan bagian dari Nekropolis yang memiliki penanggalan sejak kerajaan Romawi.[1] Penggalian ini dilaksanakan karena permintaan dari Paus Pius XI yang menginginkan untuk dikuburkan sedekat mungkin dengan Simon Petrus. Nekropolis ini pada awalnya bukan bagian dari Katakomba Roma tetapi merupakan pemakaman terbuka dengan nisan dan mausolea.
Nekropolis Vatikan dibedakan dengan Gua Vatikan yang terbentuk dari proses pembangunan Gereja Santo Petrus dan terletak di bagian dasar Basilika Konstantin lama.